Zugänge
- Hamadi Al Ghaddioui (SSV Jahn Regensburg)
- Fabian Bredlow (1. FC Nürnberg)
- Marcin Kaminski (nach Leihe an Fortuna Düsseldorf)
- Atakan Karazor (Holstein Kiel)
- Philipp Klement (SC Paderborn 07)
- Mateo Klimowicz (Instituto AC Cordoba)
- Gregor Kobel (Leihe von der TSG 1899 Hoffenheim)
- Orel Mangala (nach Leihe an Hamburger SV)
- Roberto Massimo (nach Leihe an Arminia Bielefeld)
- Pascal Stenzel (Leihe vom SC Freiburg)
- Tanguy Coulibaly (Paris Saint-Germain)
- Maxime Awoudja (FC Bayern München)
- Sasa Kalajdzic (FC Admira Wacker Mödling)
- Luca Mack (eigene U19)
- David Grözinger (eigene U21)
- Nathaniel Phillips (FC Liverpool, Leihe, August 2019)
- Wataru Endo (VV St. Truiden, Leihe)
- Silas Wamangituka (Paris FC)
- Nikolas Nartey (1. FC Köln)
- Philipp Förster (SV Sandhausen)
- Ebenezer Ofori (New York City FC, Leih-Ende, Januar 2020)
- Darko Churlinov (1. FC Köln, Januar 2020)
- Nathaniel Phillips (FC Liverpool, erneute Leihe, Januar 2020)
- Clinton Mola (FC Chelsea)
Abgänge
- Christian Gentner (1. FC Union Berlin)
- Dennis Aogo (Hannover 96)
- Andreas Beck (KAS Eupen)
- Alexander Esswein (Hertha BSC, Leih-Ende)
- Anto Grgic (FC Sion)
- Ozan Kabak (FC Schalke 04)
- Pablo Maffeo (Leihe an FC Girona)
- Alexander Meyer (SSV Jahn Regensburg)
- Benjamin Pavard (FC Bayern München)
- Hans Nunoo Sarpei (SpVgg Greuther Fürth)
- Ron-Robert Zieler (Hannover 96)
- Steven Zuber (TSG 1899 Hoffenheim, Leih-Ende)
- Ailton (Leihe an FK Qarabag)
- Erik Thommy (Leihe an Fortuna Düsseldorf)
- David Kopacz (Leihe an Górnik Zabrze)
- Timo Baumgartl (PSV Eindhoven)
- Chadrac Akolo (SC Amiens, Leihe)
- Nikolas Nartey (F.C. Hansa Rostock, Leihe)
- Anastasios Donis (Stade Reims)
- Nathaniel Phillips (FC Liverpool, Leih-Ende, Dezember 2019)
- Santiago Ascacibar (Hertha BSC, Januar 2020)
- Emiliano Insua (Los Angeles Galaxy, Januar 2020)
- Ebenezer Ofori (AIK Solna, Januar 2020)