Der fußballerisch beim TSV Westhausen auf der Ostalb ausgebildete Markus Elmer wechselte als 19-Jähriger in die A-Jugend des VfB. Nach einem halben Jahr als Jugendspieler wurde er in die weiß-rote Amateurmannschaft übernommen und bekam schließlich 1973 einen Lizenzspieler-Vertrag. Als VfB-Profi erlebte er fortan eine turbulente Zeit: In seinem ersten Jahr spielte er sich mit seinen Mannschaftskameraden zunächst bis Halbfinale des UEFA-Cups, bevor man in der nächsten Spielzeit in die Zweitklassigkeit abstieg. Nach einem bitteren Jahr in der 2. Bundesliga Süd war Markus Elmer in der Saison 1976/1977 eine der entscheidenden Stützen der Mannschaft, die den für den Verein so wichtigen Wiederaufstieg erreichte und in den Folgejahren zu einem wahren Höhenflug ansetzte.
Markus Elmer wechselte im Jahr 1980 nach 105 Bundesliga-Spielen im Trikot mit dem roten Brustring zu Bayer 04 Leverkusen, wo er schließlich verletzungsbedingt seine aktive Karriere beenden musste. Danach ist Markus Elmer als Trainer diverser Vereine dem württembergischen Fußball eng verbunden geblieben. Dem VfB hat er bis heute ebenfalls nie den Rücken gekehrt.
Der VfB dankt Markus Elmer für seinen Einsatz in insgesamt 187 Pflichtspielen (15 Treffer) und wünscht ihm Glück und Gesundheit für sein neues Lebensjahr!